标题: | 基于蚁群算法的分子对接搜索方法研究 |
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基金项目: | 广东省科技计划资助项目(2007B020706006,2007B020715001); |
关键词: | 分子对接;蚁群算法;遗传算法;能量优化; |
摘要: | 分子对接方法研究生物大分子的相互作用与识别机制,对了解生命现象及其本质规律具有重要的理论和应用价值.本文采用蚁群算法对分子对接程序Autodock 3.0的能量寻优过程进行了改进.测试了22个蛋白质-小分子体系,与原程序相比较,蚁群算法能够有效地改善程序的搜索结果.同时,比较了采用局部搜索和未采用局部搜索的算法,蚁群算法也比原程序有更好的表现.蚁群算法对分子对接的搜索方法进行了新的尝试,将对分子对接软件的改进提供一些启示. |
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