标题: | 番茄LeNHX2基因的生物信息学分析 |
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基金项目: | 四川省教育厅基金项目(项目编号:08Zb051); 乐山师范学院科研项目(项目编号:Z0858); 峨眉山生物多样性保护与利用研究所科研项目(项目编号:08S04); |
关键词: | 番茄;LeNHX2基因;Na+/H+反转运蛋白;生物信息学; |
摘要: | 应用生物信息学的方法和工具对番茄LeNHX2蛋白质的理化性质、跨膜区域、疏水性/亲水性、二级结构、结构功能域、功能分类和同源性进行分析,结果表明此蛋白为疏水性不稳定蛋白,包含一个氨氯吡嗪咪结合位点FFFLFLLPPI区域,相对分子量为58.6kD,等电点为5.50,可能存在10个跨膜区域,蛋白质二级结构的主要构成元件是α-螺旋和不规则卷曲,同源性分析发现番茄LeNHX2和其它植物的Na+/H+反转运蛋白同源性较低,但LeNHX2具有一个Na+/H+交换结构域和氨氯吡嗪咪结合位点,由此可推断LeNHX2是一个耐盐相关基因,在提高植物的耐盐能力方面可能有重要作用。 |
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